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感染幽门螺杆菌后没有特异性的临床表现，有些患者可能有上腹不适、饱胀、呃逆等表现，若发展为相关疾病则有相应的临床表现。
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1、侵入性检查（1）组织学检查：通过胃镜取胃黏膜组织，进行组织学镜检，检测幽门螺杆菌。
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（2）细菌学检查：用细菌培养方法检测幽门螺杆菌是诊断幽门螺杆菌感染的“金标准”，此方法在临床应用较少。
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（3）快速尿素酶试验（RUT）：此方法可在胃镜检查时快速进行，所以在临床应用较多。
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但近期使用抗生素、铋剂或质子泵抑制药可暂时减少细菌的数量，出现假阴性结果。
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2、非侵入性检查（1）血清学检查幽门螺杆菌感染后患者会产生相应的抗体，检测的抗体是IgG，反映一段时间内的幽门螺杆菌感染情况，不能区分患者为现症感染还是既往感染，因此不能用于治疗后幽门螺杆菌是否根除的验证试验。
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（2）13C/14C-尿素呼气试验（UBT）患者口服13C/14C标记的尿素后，若存在幽门螺杆菌感染，则幽门螺杆菌分泌的尿素酶可将尿素分解为NH3和CO2，检测呼气中同位素标记的CO2，即可诊断幽门螺杆菌感染。
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该方法操作简便、快速、准确、无创，检测阳性可确认现症感染，可用于治疗后判断幽门螺杆菌的根除效果对于接受幽门螺杆菌根除治疗的患者，应于停药4周后进行此项检查，以免出现假阴性。
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（3）粪便幽门螺杆菌抗原检测（幽门螺杆菌SA）该方法操作安全、简便，可用于幽门螺杆菌治疗前诊断和治疗后复查。
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符合下述3项之一者可判断为幽门螺杆菌现症感染：1、胃黏膜组织RUT、组织切片染色或培养3项中任一项阳性；2、13C或14CUBT阳性；3、幽门螺杆菌SA检测阳性。
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血清幽门螺杆菌抗体检测阳性提示曾经感染，从未进行过幽门螺杆菌根除治疗者可考虑为现症感染。
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幽门螺杆菌感染根除治疗后疗效的判断：应在根除治疗结束至少4周后进行。
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符合下述3项之一者可判断为幽门螺杆菌根除：1、13C或14CUBT阴性；2、幽门螺杆菌SA检测阴性；3、基于胃窦、胃体两个部位取材的RUT均阴性。
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